《中國中醫基礎醫學雜志》1995年創刊，是由國家中醫藥管理局主管、中國中醫科學(研究)院基礎理論研究所主辦，以集中、快速反映我國中醫基礎理論研究最新成果、最新進展為特色的全國唯一一家中醫理論研究期刊。雜志依托中國中醫科學(研究)院和中醫基礎理論研究所雄厚的專業人才隊伍，在導向中醫基礎理論研究，堅守中醫理論陣地方面發揮了重要作用，成為中醫理論研究、教學、科研、臨床工作者認真關注的理論性研究期刊。對我國中醫基礎理論研究受重視程度的提高和研究隊伍的擴大，起到了積極的促進作用。
《中國中醫基礎醫學雜志》以面向基層、面向農村、面向臨床為辦刊宗旨，以中醫臨床工作者和中醫愛好者為讀者對象，以堅持"寓醫理于臨床"為編輯方針，堅決執行新聞出版署和新聞出版局的有關期刊管理的規定，貫徹國家中醫藥管理局和中華中醫藥學會的辦刊要求，進一步提高辦刊質量，近年來不斷進步，隨著逐年的宣傳，雜志得到了廣大醫務工作者的認可。
《中國中醫基礎醫學雜志》創刊十年來，樹立推動中醫基礎理論研究，促進中醫學術發展的辦刊宗旨，逐漸形成并張揚自己的學術風格。立足于中醫基礎理論研究前沿，堅持繼承與發展并重，探索新理論，研究新方法，提倡理論研究帶動實驗研究，基礎研究結合應用研究。鼓勵探索爭鳴反思，支持繼承發揚創新。尤其在理論探討方面，頗多發表思考深刻、見地獨特、啟迪性強的研究性論文。愿意在引領與啟迪中醫基礎理論研究與發展走向上，能夠起到《中國中醫基礎醫學雜志》應有的影響與作用。
CSCD 中國科學引文數據庫來源期刊(含擴展版)、 統計源期刊(中國科技論文優秀期刊)、 知網收錄(中)、 維普收錄(中)、 萬方收錄(中)、 CA 化學文摘(美)、 JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)、 國家圖書館館藏、 上海圖書館館藏、
理論探討、實驗研究、臨床基礎、針灸研究、中醫寫作與翻譯、臨證驗案、述評
1、胃氣概念及其理論的發生學研究邢玉瑞
2、中醫治則基本理論問題研究于智敏，周超凡
3、從三虛致疫探討治療流感思路翟志光;李志更
4、淺議冠心病從膽論治田俊;鄔淵敏;吳敏雨;談宏強
5、潤肺止咳丸的抗炎、祛痰和鎮咳作用莫新民,孫淑榮
6、黃金分割律在中醫學理論中有重要表現裴雪重,唐韶華,夏一天
7、中醫理論特質探源──超越形態結構和實證方法曹麗英，門九章
8、乳腺增生癥與乳腺癌中醫病因病機探析董敏;潘文;王曉萍;康開彪
9、肺氣虛證穩定期慢性阻塞性肺病大鼠模型的建立張葵;滕久祥;彭芝配
10、益冠膠囊抗血栓作用的臨床與實驗研究劉劍剛,許秀森,季穎,許勇鋼
11、補腎填精方對阿爾茨海默病大鼠學習記憶行為的影響趙長安,李恩,趙京山
12、四時脈象變化規律是藏象現代研究的一個重點閃增郁;陳燕萍;汪南?;于友華
13、腸積消對IFN_γ的誘導及肺轉移的抑制王文萍,姜良鐸,飯鄉正明,佐藤淳,津田洋幸
14、幾種治療慢性腎衰常用中藥對小腸清除肌酐的影響研究黃錚,陳立平,蔣云生,羅季安
15、大鼠腎上腺次全切除腎陽虛模型胃、舌病理觀察陳小野,鄒世潔,王震,呂愛平,艾景錄
16、補腎活血方對阿爾茨海默病模型大鼠腦內膠質細胞的影響周志昆,曾紅兵,黃兆勝,汪緒元
17、復方大黃制劑對肥胖大鼠脂肪細胞瘦素及C/EBPα的影響陳愉,曲曉義,金惠銘,張國平,焦東海
18、補中益氣湯對感染白色念珠菌小鼠免疫功能調節作用的實驗研究劉春英,胡小萍,趙金茹,呂乃群
19、丹酚酸B抑制體外培養的原代大鼠肝星狀細胞的增殖王曉玲;劉平;崔云華;胡旭東;李伯勤;應馨萍
20、不同中醫治法對DEN肝癌大鼠肝臟細胞色素P450超家族的作用卓少元;方肇勤;管冬元;吳中華;高必峰
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